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新视角!天津医科大学发文:发现肺癌潜在生物标志物
2025-01-07 14:05

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【导读】多项研究已证实微生物群与癌症之间存在复杂的相互关系。然而,尽管(non-small cell lung cancer, )的微生物组成已被阐明,但关键的致病微生物群及其潜在机制仍不清楚。

1月3日,天津医科大学研究团队在期刊《Clinical And Translational Medicine》上发表了研究论文,题为“Unravelling the prognostic and operative role of intratumoural microbiota in non-small cell lung cancer: Insights from 16S rRNA and RNA sequencing”,本研究中,通过比较不同样本类型,研究人员发现了NSCLC、肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma, LUSC)和相应的正常组织之间更明显的β多样性差异。同时,肺鳞癌和肺腺癌在属水平上表现出不同的微生物组成特征。研究人员随后发现了一个具有保护作用的微生物群,包括9个与疾病延迟复发相关的属,功能分析提示这些微生物群主要发挥代谢相关功能。此外,研究人员还发现了一个有害微生物簇(HMC),包括3个属。在HMC和随后的预后模型分析中,有害的瘤内微生物群可能与感染、炎症和免疫调节有关。至关重要的是,研究人员发现了一种微生物属——消化球菌,它是一种独立的、有害的NSCLC预后因素,并可能通过肿瘤坏死因子(TNF)信号通路影响预后结局。

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https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ctm2.70156

背景信息

 01 

肺癌是一个重要的公共卫生问题,是全球肿瘤相关死亡率的首要原因。具体而言,非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)约占所有肺癌病例的80-85%。NSCLC在中国的发病率和死亡率也相当高,是一种严重影响公众健康的毁灭性疾病。NSCLC最常见的组织学类型是肺腺癌(LUAD),其次是肺鳞状细胞癌(LUSC)。在全球范围内,肺腺癌的患病率越来越高,女性的发病率也逐渐上升。因此,必须确定预防和治疗肺癌的分子策略,以应对这一重大的健康挑战。

近年来,微生物群与不同疾病之间的相关性得到了全面的研究。随着对肿瘤的广泛探索,肿瘤是无菌环境的观念已被抛弃,在数种癌症中发现了微生物群。此外,微生物群可能是肿瘤细胞和肿瘤微环境(TME)不可或缺的成分。

许多研究报道,肿瘤内微生物群可能参与肿瘤发生、发展、转移和不同治疗等异质性过程。目前,许多微生物种类被认为与肿瘤的发生密切相关,包括幽门螺杆菌在胃癌中的作用、具核梭杆菌在结直肠癌中的作用以及人乳头瘤病毒在中的作用。相比而言,在肿瘤中也发现了保护性益生菌,研究报告Akk菌可能通过多种途径抑制肿瘤生长,从而激活细胞凋亡、调节肿瘤免疫微环境(TIME)或产生特定代谢物。

胃球菌属影响预后

 02 

鉴于肺腺癌和肺鳞状细胞癌的微生物组成不同,研究人员分别对肺腺癌和肺鳞状细胞癌的预后微生物属进行了筛选,结果显示在不同组织类型之间,与预后相关的微生物属的组成存在差异。其中,胃球菌在NSCLC、肺腺癌和肺鳞状细胞癌预后方面显示出最积极的结果。高危组的胃球菌水平显著高于低危组。因此,胃球菌与较差的预后显著相关。

通过使用MR,研究人员确定了胃球菌与肺癌(p = .017,比值比(OR) = 1.149)和肺鳞状细胞癌(p = .014, OR = 1.246)之间的显著因果关系,但与肺腺癌没有关系。同样,在反向MR分析中,未发现肺癌和胃球菌之间存在因果关系。MR分析结果提示,胃球菌可能对NSCLC有促进作用,但NSCLC对胃球菌无影响。因此,胃球菌很可能是影响NSCLC预后的一个新属。

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消化球菌对预后影响的潜在机制

为了探索胃球菌影响预后的潜在通路,研究人员根据胃球菌水平将28例患者分为高丰度组和低丰度组。在多因素Cox回归分析中,这些水平与年龄、吸烟、分期、亚型和淋巴结状态一起被确定为独立的预后因素。然后研究人员使用DESeq2和edgeR方法分别在组间鉴定了108和107个DEGs,其中49个是共同的DEGs。经KEGG富集分析,肿瘤坏死因子(TNF)信号通路是主要富集通路。然后,研究人员对TNF通路中富集的基因和消化球菌丰度进行了相关分析,发现消化球菌与C-X-C基序趋化因子配体1 (CXCL1, R = 0.46, p = .013),干扰素调节因子1 (IRF1, R = 0.51, p = .0056)和前列腺素内过氧化物合酶2 (PTGS2, R = 0.50, p = .0068)呈显著正相关,而与C-X3-C基序趋化因子配体1呈显著负相关。这些观察结果表明,TNF信号通路可能是消化球菌影响预后结局的途径。通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,研究人员发现了13个核心基因产物,上述基因产物在该网络中处于核心位置。接下来,在单变量Cox回归分析中,这些基因与预后结局相关。

考虑到大多数患者处于II-IV期,研究人员也在两个I-II期NSCLC数据集中进行了相同的分析,在GSE31210数据集中发现CXCL1与预后显著相关,在GSE50081数据集中发现PTGS2与预后显著相关。因此,胃球菌可能通过影响TNF信号通路导致NSCLC患者的不良预后。

结论

 03

研究人员发现肿瘤内微生物群与NSCLC患者的预后结局显著相关。PMC主要发挥代谢功能,而HMC主要发挥感染、炎症和免疫调节作用。此外,胃球菌可能在NSCLC患者的不良预后中起着至关重要的作用,并可作为患者管理和癌症筛查的生物标志物。

【参考资料】

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ctm2.70156

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