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SpyTag/SpyCatcher系统在酵母展示技术中的应用
2024-12-21 09:22

前言

酵母是我们熟知的制作面包、酒等食品的小生物。您可知道这些单细胞生命还隐藏着惊人的“变身术”!科学家发明了一种叫做“酵母细胞表面展示技术”的方法,可以让酵母细胞展示各种各样的蛋白质,就像变身超人一样拥有了各种超能力!这为快速筛选和改造蛋白质提供了巨大便利,是蛋白工程领域的一大利器。但是这个方法在筛选过程中也存在一些缺陷,限制了其进一步发挥功效。为此,一项新研究采用了名为SpyTag的特殊胶粘蛋白,使酵母细胞展示技术化身升级,进一步提升了筛选蛋白质的速度和效率,为蛋白工程开辟了光明前景。

酵母细胞表面展示技术是什么魔法?

酵母表面展示技术是将目标蛋白质与特殊的蛋白锚定基团融合,并展示在酵母细胞表面。这就像给酵母穿上了一件针对不同目标设计的盔甲,让酵母获得了显示和固定各种蛋白质的超能力。这种方法有以下三大优势:

①、可以快速检测表面蛋白质的活性和特性。就像给蛋白质做体检一样,一目了然。

②、利用酵母自身的蛋白质生产机器帮助正确折叠蛋白质。像一个小工厂进行质量控制。

③、容易筛选和改造蛋白质。像对超人进行升级优化。

正因为这些好处,酵母表面展示技术被广泛应用于抗体和酶蛋白的筛选、活性改造等研究,是蛋白工程的绝佳平台。

传统方法也存在短板

然而,传统的酵母表面展示技术在应用中也存在一些不足。最大的问题是目标蛋白和锚定蛋白以融合的形式共同编码,容易同时受到突变影响。

在进行筛选和改造蛋白质的“生物连续进化”过程中,我们需要对目标蛋白基因进行大量的定点突变,而锚定蛋白也可能被误改变。这会导致锚定蛋白的结构和功能受到影响,进而使目标蛋白无法正确展示和固定在酵母表面。

这样一来,酵母的“变身术”就失效了,我们得不到想要筛选的优化蛋白质。这成为了传统方法的致命软肋。为了进一步发挥这项技术的强大威力,我们需要想办法避免锚定蛋白发生突变。

生物胶粘“Spy”诞生了酵母升级版

在自然界中,存在一种特殊的生物胶水,可以在两种蛋白质之间形成极其牢固的连接,这就是SpyTag和SpyCatcher系统。SpyCatcher中含有一种特殊氨基酸,可以与SpyTag中的另一种氨基酸快速结合,两者就像胶水一样粘在了一起。

SpyTag/SpyCatcher系统是通过裂解化脓性链球菌纤连蛋白结合蛋白FbaB(具有内部异肽键)的CnaB2结构域而开发的。SpyCatcher包含反应性Lys和催化性Glu,而SpyTag包含反应性Asp,SpyCatcher和SpyTag之间生成异肽键,形成共价结合复合物。SpyTag/SpyCatcher系统已用于将外来蛋白质固定到纳米颗粒和细菌外膜囊泡上。

图1 通过SpyTag/SpyCatcher基于蛋白质连接的纳米抗体在酵母细胞表面展示。

(a) 传统和 (b) 基于SpyTag/SpyCatcher的酵母细胞表面展示示意图。星号表示SpyCatcher和SpyTag之间发生的细胞内异肽键形成。SpyCatcher中的Lys31和SpyTag中的Asp117之间的反应如图中小窗口所示。

科学家灵机一动,将这套天然的胶粘系统应用到酵母表面展示技术中。他们设计了两个独立的质粒:一个编码带有SpyTag的目标蛋白。另一个编码带有SpyCatcher的锚定蛋白(图1)。

这样,两者在酵母细胞内分别表达后,就通过SpyTag和SpyCatcher之间的胶粘特性连接在了一起。最后这个融合复合体被展示到酵母表面。

这样一来,目标蛋白和锚定蛋白分开编码,就可以避免锚定蛋白的突变影响目标蛋白的展示。这就像给酵母换上了升级装备,优化了其超能力。

升级版展示技术效果如何?

科学家进行了一系列验证来检测新方法的效果:

优异的展示效率

检测发现,利用酵母整合质粒制造SpyCatcher锚定蛋白、利用酵母核质粒制造目标蛋白-SpyTag的方案展示效率可高达90%(图2)。证明新方法的连接和展示效率极高。

图2. 通过选择最佳的质粒系统来提高显示效率,以产生SpyCatcher锚定蛋白。

用于负对照酵母的质粒,在免疫染色和流式细胞术中用于指示非特异性吸附,不含纳米抗体编码序列和HA标签;相反,它含有FLAG标签。每个样本都用小鼠抗-HA标签抗体-AF488偶联的抗小鼠抗体和AF647标记的溶菌酶染色。(a)流式细胞术分析的密度图。酵母细胞比例显示在每个图表的右上角(UR)。所示数据代表三次独立实验的结果。

避免细胞间连接

通过荧光显微镜观察发现,不同酵母细胞之间并没有出现蛋白质的错位连接现象。这确保了目标蛋白仅存在于其编码的特定酵母细胞上,有利于后续的准确筛选。

优异的通用性

测试了5种不同的随机抗体,结果显示均可高效地表面展示,并正确发挥特异性识别作用。这说明新方法对目标蛋白均具有很好的适用性。

具有高效富集能力

利用流式细胞仪可以在一次筛选中高效富集目标酵母细胞,为后续快速优化奠定坚实基础。

可以看出,新方法不仅展示效率高,还规避了锚定蛋白突变的风险,尤其适合于生物进化筛选。它就像给酵母换上了升级装备,使其表面展示的超能力更加强大!

美好前景:快速优化蛋白质的“进化工厂”

该研究成功构建了一个卓越的酵母表面展示和筛选系统。科学家期待这套系统能够与生物进化技术相结合,建立一个蛋白质的快速“进化工厂”:在酵母细胞内高效引入变异,每2-3天进行一次筛选,在2-3周内完成蛋白质的快速定向优化。

小结

相比传统方式,这种生物进化筛选系统可以以超过10倍的速度获得增强效果。它将大大推进抗体和酶蛋白等各类蛋白工程的研究进程,也许很快就能孕育出更多对人类有利的“蛋白质生化战士”!

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参考文献:

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