事业单位自动离职后果：
严重的按照旷工处理，一般情况下按照辞职处理，离职后没有经济补偿金，造成单位损失的单位还可以追究责任。但对于机关和国有事业单位来讲，辞职和离职，有着本质的区别，而且意义重大。
根据法律法规和国家组织人事部门的权威解释，简单地做一下说明介绍：
第一，在机关事业单位在编人员，无论是辞职还是离职，都应该依照国家相关的组织人事制度的法定程序进行，否则，无法办理相关手续或办理无效。接收在编人员的单位也没法办理人员辞职后的调入新单位的手续。
第二，辞职的含义
企业公司的辞职是指职工根据劳动法规或劳动合同的规定，提出辞去工作从而解除劳动关系。辞职一般有两种情形，一是依法立即解除劳动关系如用人单位对职工有暴力或威胁行为强迫其劳动、不按合同约定支付工资等，职工可以随时向用人单位提出解除劳动合同的要求;二是根据职工自己的选择，提前30日以书面形式通知用人单位解除劳动合同关系。
国家机关具有领导职务的公务员的辞职是指由国家权力机关依法选出的国家机关工作人员向国家权力机关提出辞去当选职务的行为。地方组织法第二十七条规定：县级以上的地方各级人大常委会组成人员和人民政府领导人员，人民法院院长，人民检察院检察长，可以向人民代表大会提出辞职，由大会决定是否接受辞职;大会闭会期间，可以向本级人大常委会提出辞职，由常委会决定是否接受辞职。常委会决定接受辞职后，报本级人民代表大会备案。人民检察院检察长的辞职，须报经上一级人民检察院检察长提请该级人大常委会批准。
国有全民所有制事业单位的国家干部辞职，是指全民所有制在编管理人员，技术人员，辞去现所在单位的工作，与所在单位脱离了关系，然后调动至其他机关事业单位去任职。
机关事业单位在编人员的辞职，并不意味着失业，而是调出本部门本系统，然后到其他机关事业单位任职。而且辞职要依照严格的程序办理，国家人事部，对此有明确的规定，申请辞职的在编人员，要填写国家人事部专用制式的辞职申请书，所在单位也要制作工资转移证明。
按国家人事部规定：接收单位出具调档函，辞职调出单位出具转出证明，接收单位收到档案后，再出具回执给辞职调出单位。
与辞职不同，离职的概念大致分为申请离职和自动离职两大类。这里主要讲是申请离职，是指由于一定的原因，申请人向单位提出离开职务或岗位的要求，在离开岗位的事由消失后，再行回到原来的岗位或职务进行工作，当然也可以申请调动工作到其他单位。
关于离职，关键要看离职的目的，离职几个最主要的目的，有的是为处理家庭问题，有的是因照顾病人，或自己患病，有的是因为进修学习等等原因。如这些离岗的事由消除后，还可以继续回岗工作或要求调动工作。