如果商家只赔偿商品价格而不赔偿手机损坏的损失，你可以考虑以下途径来维护权益：
1. 与商家进一步沟通协商：明确指出手机进水损坏是因防水袋质量问题导致，要求其承担全部损失，摆事实讲道理，争取达成更合理的解决方案。
2. 向京东平台投诉：让平台介入处理，京东通常有相关的纠纷处理机制和规则，平台可能会督促商家妥善解决。
3. 寻求消费者协会帮助：向当地消费者协会反映情况，请求他们协助调解处理。
4. 考虑法律途径：如果损失较大且其他方法都无法解决，可以咨询律师，看是否可以通过诉讼等方式来要求商家承担手机维修或更换的费用。
